中国科学院生态环境研究中心拥有环境科学、环境工程、生态学、环境经济与环境管理、分析化学、有机化学等博士学科培养点，环境科学、环境工程、生态学、环境经济与环境管理、分析化学、有机化学等硕士学科培养点，设有环境科学与工程、生物学、生态学博士后流动站。1998年被评为中国科学院博士研究生教育重点培养基地。2003年在教育部环境科学与工程学科评估中名列前茅。 

　　自1978年恢复招收研究生以来，共招收研究生2808名，其中硕士研究生1105名，博士研究生1703名；已授硕士学位640人，授博士学位1168人；目前在读博士研究生442名，在读硕士研究生262名，在站博士后148人。自2004年开始招收留学生，目前有来自美国、尼泊尔等留学生9人，另有外籍进修生和外籍博士后数名。通过接收免试推荐的优秀本科生、实行硕博连读、加强对博士学位论文的管理、与国外联合培养等措施，为国家培养了一批生态与环境科学研究人才，为我国社会经济的持续发展和环境保护事业做出了贡献。 

　　自1990年以来，4名毕业生荣获全国“百篇”优秀博士学位论文，6名毕业生获中科院院长奖学金特别奖，13名毕业生入选中科院优秀博士学位论文，共有282人次获得中科院院长奖学金和冠名奖等各类奖励和表彰，更多学长在各自的工作领域内成为了佼佼者，令后辈晚学羡慕不已。 。